教楚小南村之战结束后，楚军遭受了严重的损失，预计伤亡人数超过参战总数的20%，其中精锐作战人员的损失尤为严重。溃退的楚军大部分没有重整，而是化为小队逃散。他们有的走上了归乡之路，有的则是化身兵匪四处抢掠。

比起军队的减员，思想上的瓦解对于楚军更为不利。信息由逃兵溃兵传播到江州各地，人们意识到无论是城墙、坞堡和军队在进击的教军面前都是十分无力的。

楚国的上流社会存在一个以儒家文人为核心，交流效率较高的舆论网络。凭借这一网络，有关教会的妖魔形象已经普及到了楚国的地方特权阶级当中。

所以当教军占领江州成为必然的将来时，作为江州秩序中坚力量的贵族和官绅便纷纷携细软逃逸，以免落入教会的魔爪。原本就在活跃的反政府起义如今更加激烈，江州的秩序基本崩溃。

为了加快接管江州的速度，宁肇将部队分为多份，还就地收编了一些投降楚军和起义者。即使教军的战斗力因为分散而削弱，残余的楚军也没能组织起有效的抵抗，反而卧底的煽动和收卖下成建制倒戈，展现出教军越打越多的奇景。

在教军先进的攻城技术进攻下，大部分城池守军完全是坐以待毙，教军攻城后稍作抵抗便快速瓦解，有的干脆直接献城投降。教军一路顺风，很快就抵达了南昌城下，包围了这座城市。由于江州刺史已离开该城，州尉官已战死，该城暂由南昌郡守负责防守。

南昌城由于城墙较为坚固，同时聚集了不少残兵，还存有一战之力，宁肇便有意劝降，争取和平接收南昌城。

“先生们，你们想好了。楚国的大军已经灰飞烟灭，如果我军发起进攻，南昌城易主的时间不会超过一天。我给你们一次投降的机会，如果你们不愿意接受，我就把你们和城内官绅贵族连同家眷全部杀干净，让你们堕入无间炼狱中接受魔鬼的折磨。”

除了对城中守军高层发起威胁外，宁肇还在城外布置了炮兵阵地，并将插有楚国军官头盔的长矛立在城下，以恐吓守军。

面对强大的敌军，南昌郡守已经不再抱有侥幸心理。好在他异地为官，家族本来就在北面，身边的一些亲人也趁早撤离了，因此不需要担心家眷的问题。

为了拖延更多时间，郡守派人向教军送信，表示自己有意投降，然而楚国有规定，被围城后一个月内投降要株连家人，只希望教军能多宽限一些时日，三十天后他亲自开门箪食壶浆以迎王师。

宁肇不可能为这种诡计所欺诈，而且就算他说的是真的她也懒得耽误十五天。教军当即对放炮轰塌了城楼，然后炸塌城墙攻城。少数死硬的守军在阻击失败后，放火焚烧市区房屋并退至南昌城衙门处继续抵抗。